1、遗传因素：如果染色体异常、遗传基因存在缺陷，常见的有精子或者卵子染色体的异常。
2、激素分泌不足难以支持胚胎发育而造成死亡。
3、子宫腔畸形使得胚胎无法生长。
4、孕期病毒感染、接触放射性物质、有毒的化学制剂、服用孕期禁止服用的药物、高温、微波、噪声、过度受刺激等。
5、母体因素：如体质差的或者患有疾病、宫颈闭锁不全、黄体功能不全、子宫内膜异位症、免疫因素、糖尿病、甲亢等。
6、男方因素：如精液中有大量细菌生长、精子畸形率高等。
专家忠告：一旦发生胚胎停育，应该查找病因，不能明确诊断，治疗上就无从下手。很难避免再次发生胚胎停育的问题。需要检查的项目有：生殖激素六项、优生优育五项、抗精子抗体、抗心磷脂抗体、抗绒毛膜促性腺激素抗体、沙眼衣原体、精子质量、卵子发育、染色体等。男性的检查项目有：一般男科检查，精子分析、生殖激素六项、免疫抗体、染色体等待。在没有确定病因之前，不宜再次怀孕，以免导致再次胚胎停育。