扁桃体炎反复发作，会形成慢性扁桃体炎。慢性扁桃体炎会导致腺体隐窝内的上皮坏死，细菌与炎性渗出物聚集其中，隐窝引流不畅，内容物不能排出，就会形成感染灶。一旦身体疲劳、感冒、压力增大、精神紧张等因素导致机体免疫力下降，滋生的细菌就会随血流到达心脏、肾脏、关节等部位，特别是溶血性链球菌很容易侵犯心脏瓣膜，引起心肌炎。
对于病情比较严重的慢性扁桃体炎患者，医生一般建议手术切除扁桃体，彻底清除感染病灶。
除了扁桃体炎会引起心肌炎外，呼吸道其他部位的病毒感染和肠道的病毒感染也可能引发心肌炎。容易感冒的人，要适当加强体育锻炼，提高机体免疫力，必要时可在医生的指导下使用一些增强免疫力的药物，如免疫球蛋白等。病毒感染一方面可引起病毒性心肌炎，另一方面可合并细菌感染或使风湿热处于活动期，从而引起其他类型的心肌炎，因此应积极做好预防工作。