奶瓶中的奶极易受到污染，容易诱发腹泻、发热等问题，而奶瓶消毒则是避免这一直接污染的最佳途径。
给奶瓶消毒最常用的是煮沸法。将水煮沸，然后先把奶瓶放入其中，煮沸10分钟；再将奶嘴放入沸水中，煮5分钟左右，捞出晾干。之所以如此分开，是因为奶嘴用橡胶或硅胶制成，耐热时间很短，久了易软化，甚至释放有毒物质。此外，还可用微波炉消毒。将清洗后的奶瓶盛上清水放入微波炉，打开高火10分钟即可。但要注意，千万不能将奶嘴及连接盖放入微波炉，以免变形、损坏。
宝宝抵抗力弱，肠胃易被感染。因此6个月之前的孩子，每次必须使用消毒过的奶瓶。因此，家里有条件的最好备4-6个奶瓶。另外，塑料奶瓶如经常消毒，易释放有毒的化学物质，最好3个月换一个。